Suite aux événements d'Avengers : L'Ère d'Ultron, Steve Rogers forme une nouvelle équipe de super-héros et après un énième incident international, l'ONU fait adopter les Accords de Sokovie (adapté du Superhuman Registration Act dans le comics original) avec l'aide de Tony Stark et du Général Ross. Alors que de nouveaux personnages font leur apparition, tels le baron Zemo et le mystérieux Black Panther, ces accords diviseront les Avengers, anciens comme nouveaux, entre d'une part les défenseurs de la liberté, menés par Captain America et qui voient ces accords comme une forme de discrimination et une menace pour eux; et d'autre part les partisans d'un contrôle, menés par Iron-Man et pour qui ces accords sont un garde-fou et une nécessité pour éviter les dérives de héros possédants des pouvoirs extrêmement puissants et donc extrêmement dangereux.